Els problemes amb els bacteris coliformes sovint es poden solucionar prenent mesures per evitar que l'aigua superficial o els insectes contaminin el subministrament d'aigua, com ara segellar una caixa de molles o utilitzar una gorra de pou sanitari. Mantenir un sistema sèptic per assegurar un correcte funcionament o controlar les fonts de residus animals prop d'un pou o molla també pot ajudar al problema. La cloració per xoc també es pot utilitzar com un enfocament únic per desfer-se dels bacteris en el subministrament d'aigua un cop controlada la font.
L'aigua bullint durant un minut matarà amb seguretat tots els bacteris, però aquesta no és una bona solució a llarg termini perquè és intensiva en energia i mà d'obra i només produeix una petita quantitat d'aigua.
Si no es pot controlar la font de bacteris al subministrament d'aigua, l'aigua potable contaminada amb bacteris es pot tractar contínuament mitjançant llum ultraviolada (UV), ozonització o cloració.
La desinfecció ultraviolada funciona matant bacteris exposant-los a llum ultraviolada. La font d'il·luminació està continguda en una màniga de vidre, i l'aigua està exposada a la llum UV com flueix sobre la màniga. Aquest mètode de desinfecció consumeix una petita però significativa quantitat d'electricitat. És important que l'aigua sigui molt clara perquè la llum UV pugui arribar als bacteris. Qualsevol cosa que faci que l'aigua sigui menys que perfectament clara, com ara sediments o matèria orgànica, s'ha de filtrar abans que l'aigua entri a la cambra de llum. La màniga de vidre també s'ha de mantenir neta d'escala o altres dipòsits que bloquegin la llum. Segueix aquest enllaç als sistemes d'esterilitzadors UV de casa sencera residencial.
La cloració introdueix contínuament clor a l'aigua a través d'un sistema de pinso. El clor pot prendre la forma d'un líquid o d'un sòlid. S'ha de col·locar un filtre abans de l'injector de clor per eliminar els sediments de l'aigua. El clor mata bacteris a l'aigua, però es consumeix en el procés. El clor també es consumeix per interacció amb altres impureses de l'aigua, com el ferro o la matèria orgànica. S'ha d'afegir prou clor perquè quedi una petita quantitat després de ser consumit per interaccions amb bacteris i altres impureses. Com que el clor residual afecta el sabor i el color de l'aigua, pot ser desitjable extreure el clor abans de beure.
La cloració també requereix una certa quantitat de temps de contacte (normalment 30 minuts) perquè mati els bacteris. A causa d'això, l'aigua sovint s'emmagatzema en un gran dipòsit de subjecció o corre a través d'una sèrie de canonades enrotllades després de ser clorada. Els sistemes de clor s'han de mantenir per garantir un bon funcionament, i el subministrament de clor s'ha de reposar periòdicament.
L'ozonació és similar a la cloració, ja que l'ozó s'injecta a l'aigua i mata bacteris. L'ozó és un gas que es produeix amb electricitat i després s'injecta a l'aigua. Els sistemes d'ozonització són més costosos que la llum UV o els sistemes de cloració, però poden tractar l'aigua per a múltiples contaminants, com bacteris, ferro i manganès.
